JUKOn ylin päättävä elin on liittokokous. Toimintaa johtaa hallitus. Hallitus edustaa neuvottelujärjestöä ja tekee sen puolesta sopimuksia.
Julkisalojen sopimuksista päättävät käytännössä hallituksen asettamat kunnan, hyvinvointialueiden, valtion, yliopiston ja kirkon neuvottelukunnat. Muiden sopimusten hyväksymisestä tai hylkäämisestä päättää JUKOn hallitus, joka myös vahvistaa neuvottelukuntien päätökset.
Toimielintemme tarkemmat tehtävät on määritelty JUKOn säännöissä, lue tästä.
Puheenjohtaja Katarina Murto (OAJ)
| Varsinainen jäsen | Varajäsen |
| Lauri Hietalahti (OAJ) | Pasi Repo (OAJ) |
| Jenni Karsio (Talentia) | Tuomas Hyytinen (Talentia) |
| Katariina Kattelus (OAJ) | Santeri Palviainen (OAJ) |
| Timo Kaukonen (Lääkäriliittojen neuv. järj.), vpj | Nora Savanheimo (Lääkäriliittojen neuv. järj.) |
| Petri Lindroos (OAJ) | Eila Urpilainen (OAJ) |
| Jari Lipsanen (Vakava), vpj | Arja Varis (Vakava) |
| (Tieteentek.) | Hanna Tanskanen (OAJ) |
| Anitta Pakanen (OAJ) | Kirsi Sutton (OAJ) |
| Heta Piirto (Vakava) | Arja Lusa (Vakava) |
| Jore Tilander (JEA), vpj | Kari Eskola (JEA) |
| Puhe- ja läsnäolo-oikeus | |
| Eve Becker | |
| Tuomas Hyytinen | |
| Jussi Junni | |
| Kukka Junno | |
| Jari Järvi | |
| Harri Liikkanen | |
| Tiina Mäkinen | |
| Tarja Niemelä | |
| Jonne Rinne |