JUKOn ylin päättävä elin on liittokokous. Toimintaa johtaa hallitus. Hallitus edustaa neuvottelujärjestöä ja tekee sen puolesta sopimuksia.
Julkisen sektorin sopimuksista päättävät käytännössä hallituksen asettamat hyvinvointialueiden, kirkon, kunnan, valtion ja yliopiston neuvottelukunnat. Muiden sopimusten hyväksymisestä tai hylkäämisestä päättää JUKOn hallitus, joka myös vahvistaa neuvottelukuntien päätökset.
Toimielintemme tarkemmat tehtävät on määritelty JUKOn säännöissä, lue tästä
Puheenjohtaja Olli Luukkainen (OAJ)
| Varsinainen jäsen | Varajäsen |
| Jenni Karsio (Talentia) | Tuomas Hyytinen (Talentia) |
| Katariina Kattelus (OAJ) | Lauri Hietalahti (OAJ) |
| Laura Lindholm (Lääkäriliittojen neuv. järj.), vpj | Nora Savanheimo (Lääkäriliittojen neuv. järj.) |
| Petri Lindroos (OAJ) | Eila Urpilainen (OAJ) |
| Johanna Moisio (Tieteentek.), vpj | Hanna Tanskanen (OAJ) |
| Katarina Murto (OAJ) | Markku Perttunen (OAJ) |
| Anitta Pakanen (OAJ) | Kirsi Sutton (OAJ) |
| Heta Piirto (Vakava) | Arja Lusa (Vakava) |
| Jore Tilander (JEA), vpj | Kari Eskola (JEA) |
| Ville Viita (Vakava), vpj | Arja Varis (Vakava) |
| Puhe- ja läsnäolo-oikeus | |
| Eve Becker | |
| Anu Halonen | |
| Tuomas Hyytinen | |
| Jussi Junni | |
| Kukka Junno | |
| Jari Järvi | |
| Harri Liikkanen | |
| Tarja Niemelä | |
| Jonne Rinne |