JUKOn ylin päättävä elin on liittokokous ja sen toimintaa johtaa hallitus. Hallitus edustaa neuvottelujärjestöä ja tekee sen puolesta sopimuksia.
Julkisen sektorin sopimuksista päättävät käytännössä hallituksen asettamat kirkon, kunnan, valtion ja yliopiston neuvottelukunnat. Muiden sopimusten hyväksymisestä tai hylkäämisestä päättää JUKOn hallitus, joka myös vahvistaa neuvottelukuntien päätökset.
Toimielintemme tarkemmat tehtävät on määritelty JUKOn säännöissä, lue tästä
Puheenjohtaja Olli Luukkainen (OAJ)
| Varsinainen jäsen | Varajäsen |
| Helena Kahl (OAJ) | Markku Perttunen (OAJ) |
| Jenni Karsio (Talentia) | Paula Kangasmaa (Talentia) |
| Petri Kääriäinen (OAJ) | Kari Nieminen (OAJ) |
| Laura Lindholm (Lääkäriliittojen neuv. järj.), vpj | Nora Savanheimo (Lääkäriliittojen neuv. järj.) |
| Petri Lindroos (OAJ) | Eila Urpilainen (OAJ) |
| Arja Lusa (Vakava) | Annamari Jokinen (Vakava) |
| Johanna Moisio (Tieteentek.) | Hanna Tanskanen (OAJ) |
| Anitta Pakanen (OAJ) | Kirsi Sutton (OAJ) |
| Jore Tilander (JEA), vpj | Kari Eskola (JEA) |
| Ville Viita (Vakava), vpj | Tarja Niemelä (Vakava) |
| Puhe- ja läsnäolo-oikeus | |
| Eve Becker | |
| Tuomas Hyytinen | |
| Jussi Junni | |
| Jari Järvi | |
| Kukka Junno | |
| Tiina Mäkinen | |
| Harri Liikkanen | |
| Jonne Rinne |